在生物制藥領域，真空冷凍干燥技術與其他干燥方法相比，有著很多優勢。

1、凍干藥液在凍干前分裝，分裝方便，可實現連續化。

2、凍干處理條件溫和，在低溫低壓下干燥，有利于熱敏物質保持活性，可避免藥品在高溫高壓下分解變性，保護蛋白質不會變性。

3、凍干完成后，制品含水量。凍干產品含水量一般在1%~3%之間，產品不易被氧化，有利于長途運輸和保存。

4、凍干產品外觀較好，復水性強。凍干藥品為多孔疏松結構且顏色基本不變，復水性好，凍干藥品能迅速吸水還原成凍干前狀態。

5、凍干設備封閉操作，安裝環境潔凈度高，減少雜菌和微粒的污染，干燥中和封裝后的缺氧可起到滅菌和抑制某些細菌活力的作用。